Auf Initiative des Münsteraner Kaplans Carl Böddinghaus wurde im Jahre 1880/1882 die katholischen Kapelle mit dem Patrozinium Maria Meeresstern als kleine Backstein-Hallenkirche mit Querhaus und Laternen-Dachreiter in neugotischem Stil erbaut.
1905 wurde sie nach Westen um ein Joch erweitert.
Ein Mehrzweckkirchsaal wurde 1954 im Osten angebaut.
Ihr heutiges Aussehen erhielt die Kirche 1987/1988 durch Hinzufügung einer Vergrößerung im Westen mit einer geräumigen Empore, dem neuen Bronze-Portal und einem hohen und schlanken oktogonalen Glockenturm mit vierstimmigen Geläut.
Seit dem 1. September 2010 bildet die Borkumer Pfarrei mit der Pfarrei Christ König in Emden eine Pfarreiengemeinschaft.